色素痣手術切除是首選的治療方法，但是只要皮膚進行手術，必然會留下疤痕，越小的色素痣，遺留的疤痕越小，所以需要盡早治療。較大的色素痣，采取分次切除的辦法，遺留的疤痕相對比較小。對于大一些的先天性色素痣，常用皮瓣法或者是擴張器法。擴張器法讓正常的皮膚覆蓋色素痣，遺留的疤痕是線狀的疤痕，影響較小。