目前為止，胃腸道間質(zhì)瘤的病因尚不明確。臨床上大多數(shù)惡性腫瘤的病因均不明確，只有極個(gè)別惡性腫瘤有明確的病因。大部分惡性腫瘤均由于綜合因素引起發(fā)病，包括家族遺傳因素、環(huán)境因素、飲食因素、生活習(xí)慣變化等。因大部分惡性腫瘤病因不明，所以暫時(shí)無(wú)法找到有效的根治方法。