肛門鏡檢查一般不會引起肛門強烈的疼痛，有可能會出現(xiàn)輕微疼痛，但主要不適是異物感。因此做肛門鏡檢查不用過度擔心，多數情況下不適感是異物感，是肛門直腸對異物的侵襲的不耐受。肛門直腸神經分布非常豐富，對異物非常敏感，但是并不會造成過多或嚴重的疼痛。肛門鏡的直徑與硬質粗便大小差不多，所以正常肛門一定能容納肛門鏡。因為肛門鏡檢查出現(xiàn)的疼痛多數情況下由肛門本身固有疾病引起，如嚴重肛裂、肛門直腸周圍膿腫、嵌頓痔或絞窄痔，即本身以疼痛癥狀為主的肛腸疾病，在做肛門鏡檢查時也必然出現(xiàn)強烈疼痛。對于不是以疼痛為主的肛腸疾病，做肛門鏡檢查時絕大多數患者僅出現(xiàn)肛門異物感、不適感。因此，有肛腸疾病的患者不用太在乎或太顧忌肛門鏡檢查。對于肛腸疾病初診患者，肛門鏡檢查是必須且應該做的檢查。