懷孕六周可以藥流，但是在決定做藥物流產之前要全面的評估。藥物流產主要是針對停經在49天以內，超聲下胎囊直徑小于2cm的早期妊娠的女性，如果病人沒有米非司酮和米索前列醇兩種藥物的過敏史和禁忌癥的前提下，就可以選擇藥物流產。懷孕六周屬于藥流產可以做的一個階段，但是流產的成功率并不是100%，一般藥物流產的成功率只能達到80%-90%左右，也就是說有一定的失敗率。如果藥物流產失敗還需要再次進行手術的清宮治療。藥物流產主要是分兩次給藥，第一次服用米非司酮，間隔48小時之后服用米索前列醇。如果有肝功能異常、腎功能異常的病人不能服用米非司酮，有青光眼、哮喘等等前列腺素類藥物禁忌癥和過敏史的病人，也不能服用米索前列醇。另外在服藥之前要判斷胚胎的大小，經過超聲檢查確定了超聲胚胎大小，在藥物流產的范圍之內才可以進行藥物流產。