巧克力囊腫有一定惡變概率，在1%左右，概率比較低。 育齡期婦女的治療主要是針對(duì)疼痛和不孕進(jìn)行，對(duì)于絕經(jīng)以后的巧克力囊腫，重點(diǎn)為預(yù)防惡變。如果囊腫比較小，可以嚴(yán)密的隨診觀察，對(duì)于絕經(jīng)后的女性，如果囊腫短期內(nèi)長(zhǎng)大，甚至疼痛節(jié)律發(fā)生變化，應(yīng)該積極進(jìn)行手術(shù)干預(yù)，明確診斷、切除病灶。對(duì)于有癥狀的女性，如巧克力囊腫＞5cm，有生育要求應(yīng)該進(jìn)行積極的手術(shù)干預(yù)。